Røkkesdalen-Skogndalen naturreservat ligger i Levanger kommune, Trøndelag, og dekker et område på ca. 5860 dekar. Området er preget av markerte dalganger og et variert landskap med heiområder, naturskoger, rikmyrer og kalkrike berg. Dette gir en stor variasjon i vegetasjon og økosystemer, fra fattige til rike vegetasjonstyper. Spesielt bemerkelsesverdig er forekomsten av kalkplanter og gammel skog med høgstaudeutforming.
Verneformålet for Røkkesdalen-Skogndalen er å bevare et lite påvirket skogområde med naturskog, og områdets betydning for naturmangfoldet. Vernet omfatter også bevaring av det samiske naturgrunnlaget. Forskriften for området fastsetter strenge regler for å beskytte vegetasjon, dyreliv og naturmiljøet generelt. Tiltak som kan endre naturmiljøet, som bygging, gjødsling, eller motorferdsel, er forbudt. Samtidig er aktiviteter som beiting, sanking av bær og matsopp, samt jakt og fiske tillatt under visse betingelser.
Forvaltningsmyndigheten for området er Statsforvalteren i Trøndelag, og det er utarbeidet en forvaltningsplan som gir retningslinjer for forvaltning og skjøtsel av naturreservatet. Forskriften om vern av Røkkesdalen-Skogndalen naturreservat trådte i kraft 16. desember 2011 og er hjemlet i naturmangfoldloven §§ 34, 37 og 62.