Apoteket naturreservat ligger i Trondheim kommune og er kjent for sine varmekjære plantesamfunn, inkludert tørrberg, tørrbakker, hasselkratt og almeskog. Området er hjem til en rekke sjeldne arter som vårmure, kung, kransmynte, raudflangre, samt sjeldne sopper som grålilla trevlesopp. Naturreservatet har et urskogpreg i deler av området og dekker et areal på omtrent 54 dekar.
Verneformålet for Apoteket naturreservat er å bevare et edellauvskogsområde med et bredt spekter av varmekjære plantesamfunn, samt å verne det vakre landskapet og dyrelivet. Fredningen ble formelt etablert ved kongelig resolusjon den 6. februar 1987. Forskriften fastsetter strenge regler for området, inkludert forbud mot motorisert ferdsel, innføring av nye plantearter og bygging av faste innretninger. Unntak fra disse reglene kan gjøres for vitenskapelige undersøkelser og tiltak av vesentlig samfunnsmessig betydning, dersom de ikke strider mot verneformålet.
Forvaltningsmyndigheten er lagt til Statsforvalteren i Trøndelag, som har ansvar for å gjennomføre nødvendige skjøtselstiltak for å fremme fredningsformålet. Reservatet er også underlagt IUCN kategori IA, som betegner strengt beskyttede områder.